Melanjutkan cerita sebelumnya dengan kehadiran para autobot ke bumi yang
masing asing, kini Autobot telah diterima kehadirannya oleh Militer
Amerika, namun masih dirahasiakan dari masyarakat umum. Bersama-sama,
antara militer dan Autobot mereka membentuk unit rahasia (NEST) dengan
tujuan utama adalah untuk menghentikan dan memburu Decepticon di seluruh
dunia. Di Shanghai - China, dengan menyamar sebagai kebocoran gas,
pemerintah China mengosongkan kota Shanghai sehingga gabungan pasukan
Manusia dan Autobot dapat berperang melawan Decepticon.